Naoto Kubota

A computational biologist

こんにちは、カリフォルニア大学リバーサイド校医学部にて博士研究員をしている久保田直人です。現在は Sika Zheng 博士が主催する研究室に所属しています。

専門はゲノム情報生物学 (Computational genomics）です。次世代シーケンサー（NGS）によって産生される大規模なデータセットの解析を通して、哺乳類における転写制御やスプライシング、およびそれらと関連する遺伝要因の探索について研究を行っています。

略歴

  • 2022年5月-現在 カリフォルニア大学リバーサイド校 博士研究員

  • 2019年4月-2019年9月 バルセロナスーパーコンピューティングセンター 客員研究員

  • 2020年6月-2022年3月 九州大学 生体防御医学研究所 助教

    • システム免疫学統合研究センター 情報生物学分野
    • PI：須山 幹太 教授

  • 2020年7月 九州大学大学院システム生命科学府 一貫制博士課程 修了、博士号取得（理学）

    • 学位論文：「公共データの統合・再解析に基づく乾癬発症リスクと関連する機能多型の網羅的探索」
    • 指導教員：須山 幹太 教授

  • 2017年3月 神戸大学大学院 農学研究科 博士前期課程 修了、修士号取得（農学）

    • 学位論文：「哺乳類生殖腺における性決定関連遺伝子とエピゲノム制御」
    • 指導教員：星 信彦 教授

  • 2015年3月 神戸大学 農学部 卒業、学士号取得（農学）

受賞歴等

  • 2022年5月-2023年4月 上原記念生命科学財団 海外留学助成 ポストドクトラルフェローシップ 採択

    • 「神経変性疾患におけるスプライシング因子制御異常の大規模情報解析」

  • 2022年4月-2024年3月 JSPS 科学研究費補助金 若手研究 採択（海外留学のため交付留保中）

    • 「プロモーター選択を制御するSNPの解析と疾患研究への応用」

  • 2019年4月-2019年9月 JSPS 若手研究者海外挑戦プログラム 採択

    • バルセロナスーパーコンピューティングセンター 客員研究員 (PI：David Torrents 博士)
    • 「生命科学ビッグデータ解析に基づく非コード領域が関与する疾患発症メカニズムの解明」

  • 2018年4月-2020年3月 JSPS 特別研究員 DC2

    • 「比較ゲノムとHi-Cデータに基づくシス因子を介した転写調節とその破綻機構の解明」

連絡先

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