プロフィール

こんにちは、カリフォルニア大学リバーサイド校医学部にて博士研究員をしている久保田直人です。現在は Sika Zheng 博士が主催する研究室に所属しています。

専門はゲノム情報生物学 (Computational genomics）です。次世代シーケンサー（NGS）によって産生される大規模なデータセットの解析を通して、哺乳類における転写制御やスプライシング、およびそれらと関連する遺伝要因の探索について研究を行っています。

略歴

博士研究員 | カリフォルニア大学リバーサイド校
2022年5月 - 現在
PI：Sika Zheng 博士

客員研究員 | バルセロナスーパーコンピューティングセンター
2019年4月 - 2019年9月
PI：David Torrents 博士

助教 | 九州大学生体防御医学研究所
2020年6月 - 2022年3月
システム免疫学統合研究センター情報生物学分野
PI：須山幹太教授

博士号取得（理学） | 九州大学大学院システム生命科学府
2020年7月修了
学位論文：「公共データの統合・再解析に基づく乾癬発症リスクと関連する機能多型の網羅的探索」
指導教員：須山幹太教授

修士号取得（農学） | 神戸大学大学院農学研究科
2017年3月修了
学位論文：「哺乳類生殖腺における性決定関連遺伝子とエピゲノム制御」
指導教員：星信彦教授

学士号取得（農学） | 神戸大学農学部
2015年3月卒業
指導教員：星信彦教授

上原記念生命科学財団海外留学助成ポストドクトラルフェローシップ
2022年5月 - 2023年4月
「神経変性疾患におけるスプライシング因子制御異常の大規模情報解析」

JSPS 科学研究費補助金若手研究
2022年4月 - 2024年3月（海外留学のため交付留保中）
「プロモーター選択を制御するSNPの解析と疾患研究への応用」

JSPS 若手研究者海外挑戦プログラム
2019年4月 - 2019年9月
バルセロナスーパーコンピューティングセンター客員研究員
「生命科学ビッグデータ解析に基づく非コード領域が関与する疾患発症メカニズムの解明」

JSPS 特別研究員 DC2
2018年4月 - 2020年3月
「比較ゲノムとHi-Cデータに基づくシス因子を介した転写調節とその破綻機構の解明」

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メール： naotok [at] ucr.edu
X： @kubotter_123 もしくは @naoto_kubota